Visuelle Analytik für Genexpressionsdaten

Microarrays oder DNA-Chips sind eine der erfolgreichsten Technologien zur
Genexpressionsanalyse, die in den letzten Jahren Einzug in die Molekularbiologie und
Medizin gehalten haben. Bei der Datenauswertung im Rahmen der Microarray-Analyse
besteht aber nach wie vor ein großer Bedarf an sowohl benutzerfreundlicher, als auch
leistungsfähiger Software, die den schnelllebigen Technologiesprüngen und wachsenden
Datenumfängen Rechnung trägt. Bei der Analyse von Microarray-Daten spielen dabei die
automatische Auswertung und die visuelle Exploration eine wichtige Rolle.
Mit SpRay wurde ein Werkzeug geschaffen, das für die Exploration und Analyse
derartiger Daten ausgelegt ist. Zentrale Visualisierung ist eine Adaption und Erweiterung der
parallelen Koordinaten und der Heatmap. SpRay bietet eine visuelle Analyse sowohl von
Original- als auch automatisch abgeleiteten (statistischen) Daten in einem gemeinsamen
Visual-Analytics-Datenraum.
Anhand einiger Anwendungsbeispiele aus verschiedenen Microarray-Studien wird die
Zweckmäßigkeit von SpRay demonstriert.